细胞代谢组学样本处理-代谢组学组织标本处理

摘要： 本文目录一览：1、【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合2、...

本文目录一览：

• 1、【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合
• 2、代谢组学的结果能看出来样本量么
• 3、代谢组学的研究方法
• 4、做好代谢组学研究的关键在哪里?
• 5、简述代谢组学的概念、研究技术和应用

【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合

这里我们用基于秩的检验方法，其中基因集富集分析(GSEA)是在转录组数据背景下进行代谢路径分析的一个常见例子，它也可以应用于代谢组数据。

肝脏疾病与肝细胞分裂能力下降密切相关，并且细胞代谢对组织稳态和再生很重要。由于代谢变化是肝脏疾病的标志，因而对代谢和细胞分裂之间的联系进行了研究。

代谢组学隶属于组学范畴之内，目前关注度颇高，它是了解小分子代谢物质(相对分子质量小于1000)数量、种类、丰度的研究技术，可以对小分子物质进行全面的定性及定量分析，并寻找代谢物与环境因子变化的相对关系。

代谢组学的结果能看出来样本量么

1、成功的代谢物组学研究依赖于有效的代谢物提取，并去除无需分析的蛋白质等成分，因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物，调整水相/。结果表明。

2、代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息。

3、看第4行的结果。根据查询费舍尔检验相关信息得知，费舍尔检验结果看第4行的结果。当总样本量n40，或最小理论频数T1，或检验所得P值接近于检验水准α，用Fisher确切概率法检验。

4、正态性检验结果大数据看左边大数据是大于100的。正态性检验就是看数据（针对计量资料而言）符不符合正态分布，这决定接下来的数据分析将用参数检验还是非参数检验，方法使用错误可能对结果分析产生很大的影响。

代谢组学的研究方法

1、一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。

2、研究中药这种复杂混合物的毒性，代谢组学是最好的方法，选择不同产地、不同数量、不同组分的中药，做出代谢组图，根据组成变化与毒性、药效相对应，就可把有效的成分最大化，把有毒的东西剔除。

3、先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。

4、从一个生物样本中筛选出数千种代谢物，为探究疾病机理提供了一种更全面的方法。这一方法的重要性明显体现在Gilead公司应用代谢组学建立的动物模型实验中。使用乙酰辅酶A羧化酶抑制剂所取得的成功。

5、代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。

6、动物方面如果是动态取血，一般用大鼠眼眶内眦静脉丛取血。如果是一次性取血，大鼠用腹主动脉取血，小鼠可以用心脏取血或者腹主动脉取血。理论来说，血清做代谢组学效果会更好，血清中代谢物的含量略高于血浆。

做好代谢组学研究的关键在哪里?

研究代谢组学的关键是要发展大规模、并行化测定复杂混合体系中代谢物组成信息和对大量数据进行分析和建模的能力。技术手段的发展是代谢组学发展的关键因素。

代谢组学的研究方法：代谢组学研究一般包括代谢组数据的集、数据预处理、多变量数据分析、标记物识别和途径分析等步骤。生物样品(如尿液、血液、组织、细胞和培养液等)集后进行生物反应灭活、预处理。

代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物。 代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游，所提供的是生物学的终端信息。

简述代谢组学的概念、研究技术和应用

代谢组学 ：利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。代谢组学应用：PS：TIC是在GC-MS或LC-MS等方法中使用的一种色谱图。

概述代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

代谢组学研究可分为两类：“发现代谢组学”(也称“非靶向代谢组学”)和“靶向代谢组学”。